1991 yılında Moldova’nın bağımsızlığını tanıyan ilk ülkelerden biri de Türkiye olmuştur.

1994’de imzalanan Yatırımların Karşılıklı Teşviki ve Korunması Anlaşması ve Uluslararası Karayolu Taşımacılığı Anlaşması’nın ardından iki ülke arasında pek çok anlaşma ve protokol imzalanmıştır. Günümüzde, toplam yatırım miktarı 220 milyon doları aşmış yaklaşık 500’ün üzerinde Türk işletmesi Moldova’da faaliyet göstermektedir. Bunların faaliyet alanları gıda, içecek, tekstil, telekomünikasyon, hazır giyim, taşımacılık, restaurant işletmeciliği gibi çok geniş bir yelpazededir. Türkiye’de ise yaklaşık 50 Moldova sermayeli işletme bulunmaktadır.

Ayrıca Moldova Cumhuriyeti’ne bağlı Gagauz Özerk Bölgesi Türkiye için önemlidir. Gagauzlar Oğuzların Gök Oğuz boyundan gelen Türk kökenli halktır. Gagauzca Türkçe’ye çok yakın bir dildir. Gagauz Özerk Bölgesi’nin yaklaşık 2000 bin nüfusu var. Türkiye’nin Gagauzya’da ticaret ve eğitim alanında çok sayıda yatırımı bulunmaktadır. Aynı zamanda Türkiye bu bölgeye büyük oranda yardım yapmaktadır.

Türkiye’de; Moldova’nın Ankara Büyükelçiliği ve İstanbul Başkonsolosluğu, İzmir Fahri Konsolosluğu yer alırken, Türkiye’nin de Kişinev Büyükelçiliği bulunmaktadır.